第一，我国难以利用的土地面积比例高，土地利用率低，尤其是耕地资源紧缺，后备耕地资源不足。由于海陆分布、地形地势、气候的影响，我国境内有流动沙丘6.7亿亩，戈壁8.4亿亩，4000料以上高山29.09亿亩，难以利用土地总面积达44.19亿亩，占我国土地面积的30.68%。从目前我国土地利用结构看，用于农林牧的土地占57.8%，其中耕地仅占14%，低于世界平均数，加之后备耕地资源毛面积仅5亿亩，真正可垦为耕地的仅1—2亿亩。随着社会经济的发展，耕地将不断被占用，耕地数量将持续下降。
第二，我国自然资源的时间分布不协调。我国大部分地区年降水量的70—80%集中在6—9月，并多以暴雨形式出现，容易出现洪涝、干旱等自然灾害；我国草地面积虽广，但限于气候条件，夏秋草场和冬春草场不平衡，限制草地的载畜量。
第三，我国区域资源不匹配，自然资源分布与生产力分布不协调。我国草地和地下矿产资源集中于四北部，而耕地和生产力高的区域相对集中于东南部，自然资源与生产力分布错位，北煤南运，南粮北调，造成运输紧张，生产成本增高。
第四，我国资源质量差异悬殊，低劣资源所占比重较大。在我国已探明储量的148种矿种中，占有明显优势的除煤外，多数是用量较小的有色金属和非金属矿种。我国90%以上的铁矿为贫矿，很多矿种的采、选、冶亦较困难。在农用矿产中，磷矿亦多为贫矿。此外，在我国的能源中，优质能源石油、天然气只占很小比例，其余为煤，这就决定了我国能源结构中以煤为主的格局。
第五，人均资源量少。我国各类主要自然资源的人均占有量水平都低于世界平均水平，人均土地面积为三分之一，人均水资源为四分之一，人均森林面积为六分之一，人均草地面积为三分之一，矿产资源潜在价值的人均值也只及世界人均的二分之一。我国人均占有资源量偏少这一状况将随着我国人口的持续增长而加剧。
我国主要资源人均占有量在世界144个国家的排序：
土地面积 110位以后
耕地面积 126位以后
草地面积 76位以后
森林面积 107位以后
淡水资源量 55位以后
45种矿产潜在价值 80位以后
我国自然资源的劣势将对我国社会经济的发展产生深远的影响，应根据我国资源状况和社会经济发展的需求，尽快制定我国自然资源开发利用总体战略。其次，我国自然资源相对短缺，应充分利用资源互补特性，如我国粮食紧缺，就应充分利用食物的多样性，来弥补我国人均粮食占有水平较低的状况。类似的情况在国外也可以找到，如有的国家狠抓奶牛饲养，大大提高牛奶产量，相应地缓解了粮食供求矛盾。另外，要重视再生资源的综合利用，这里包括：农林牧的副产品的利用，如饼渣、秸秆、废旧金属的再利用；污染物资源化，如污水资源化；矿区的复垦等等。随着社会经济的发展，我国需要的资源量大量增加，我们应确定一次资源与二次资源之间的相应比例，以及在相应的部门间资源再分配的关系，对二次资源的开发利用给予扶持和优惠。